محیط و تجهیزات آزمایشگاه کنترل باید طبق الزامات عمومی و اختصاصی نواحی کنترل کیفیت باشد. در این ارتباط  آزمایشگاههای کنترل کیفیت باید از بخش های تولید مجزا باشد.این مسئله خصوصا برای آزمایشگاههای کنترل بیولوژیک میکروبیولوژی و رادیوایزوتوپ ها مهم است که باید از یکدیگر نیز جدا باشند.

آزمایشگاههای کنترل کیفیت باید به گونه ای طراحی شود که با عملیاتی که در آن انجام می شود تناسب داشته باشد. فضای کافی و مناسب برای نگهداری نمونه ها و سوابق موجود باشد.

اتاق های مجزا لازم است تا دستگاه های حساس را ار لرزش تداخل الکتریکی و رطوبت و دیگر خطرها حفظ کند.

الزامات خاصی برای آزمایشگاه هایی که با مواد خاص مانند نمونه های بیولوژیکی یا رادیواکتیو کار می کنند باید در نظر گرفته شود.

کارکنان محیط و تجهیزات در آزمایشگاه ها باید با وظایف محوله با توجه به ماهیت و میزان عملیات ساخت متناسب باشد. استفاده از آزمایشگاه های بیرون از مرکز تولید باید بر طبق اصول خاص صورت پذیرد و این موارد باید در گزارش های کنترل کیفی ثبت شود.